Такая беда случается, если:
Скважина на воду пробурена неправильно, либо на очень слабый водоносный горизонт. При включении насоса, если его мощность превышает допустимый дебит скважины, уровень воды опускается вниз на уровень фильтра, и воздух из грунта (из затрубного пространства) попадает внутрь скважины и через насос идёт по трубам с водой.
Если причина в этом, то необходимо поприжать выход воды из насоса (с помощью крана), либо поменять насос на менее мощный насос (но чтобы его мощности при этом хватило на то, чтобы поднять воду из скважины на поверхность).
Возможно, воздух попадает через неплотные соединения водопроводных труб, идёт подсасывание воздуха.
Причина – неправильно смонтированное оборудование, неправильно выполнена обвязка скважины. Возможно, на насосе не поставили клапана обратного хода, возможно, не поставили расширительный (мембранный бак), либо еще что-то сделали не так.